Cell | 免疫疾病中淋巴细胞特异基因调控动态全景图

大阪大学的研究工作执法人员和RIKEN Research研究工作所的同事们已经构建了首个针对自身诱发病因和自身炎症性病因的基因组在线。想这一能源能为致病病因的的发展提供新的见解，并意味著有助于药物的断定。研究小组们还想，与致病之外的线粒体样本图集最终意味著运用于诸如COVID-19等传染病的研究工作。

大阪大学建设项目研究工作助理，医学风湿病学家，特性线粒体学专家学者Mineto Ota博士说道：“要了解病因，就必须深刻理解基因组变异的特性。有了这个样本集，我们就可以将与病因之外的DNA碱基转变的样本与对病因发病机制颇为最重要的基因组和细胞会子类紧密联系起来。”Ota是该小组发表在《Cell》Magazine上的文中的主要作者，文中原文为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该建设项目是与Chugai Pharmaceutical的研究小组们合作顺利进行的。

作者写道，致病酪氨酸的病因（IMD）还包括从自身诱发到自身炎症的多种病理。他们指成，尽管IMD中都炎性细胞会因子的反常活动表明病原体特性发生了转变，但是，“对于IMD的之外基因组甚至之外细胞会子类鲜为人知。”

以外线粒体关联研究工作（GWAS）断定了许多与IMD之外的线粒体位点。但是，在此类关联研究工作中都鉴定成的许多基因组变异都坐落于调节基因组“on”或“off”表述的DNA非字符地区，而不是坐落于基因组字符碱基中都。研究工作人小组指成：“GWAS已经洞察了许多与复杂突变和病因之外的线粒体位点，还包括IMD。这些变异中都的大多数都坐落于非字符线粒体地区，尤为是调节元件，如增强子和内含子。”

为了洞察调节DNA的特性，一种不同子类的线粒体分析，称为表述计量突变基因组位点（eQTL），旨在将DNA碱基的关联性与基因组表述的关联性紧密联系起来。利用eQTL样本，研究工作执法人员可以对调节DNA碱基的用以、调节碱基中都的变异如何影响其调节基因组的表述以及这些基因组表述关联性如何避免病因做成非常固执的猜测。

其它针对致病的eQTL研究工作已经在顺利进行中都，但先前的研究工作工作只还包括卫生青年人，并检查了有限数量的细胞会子类。研究工作执法人员写道：“对卫生诱导病原体的研究工作意味著无法捕捉到病因静止状态下断定的一系列eQTL波动。此外，虽然对病原体的实验性诱发可以在同样上模拟病因静止状态，但并不总是揭示成肝脏的生理环境。”

Ota必要道：“炎症静止状态下，病原体的物理特性与卫生静止状态下的完全一致细胞会各不相同。与致病精神状态之外的基因组变异意味著只在患病静止状态下起关键作用，因此对于这种子类的基因组研究工作，从真实病变额头获取样本颇为最重要。”

在他们当前媒体报道的研究工作中都，研究工作人小组对79名卫生青年人和337名被诊断患有10种不同子类致病酪氨酸病因（还包括类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和系统性结节病）的病变顺利进行了以外线粒体测序。所有青年人都是欧美后裔。

了解致病酪氨酸的病因具有挑战性，因为尽管每种病因在医学上都是不同的，但仍有许多重叠之处，并且具有完全一致诊断的病变意味著会平庸成颇为不同的症状。研究工作执法人员必要说道：“由于所有这些多样性，一次学习一种致病酪氨酸病因的能力是有限的。但是，如果我们一起研究工作10种病因，就可以非常进一步地了解这些子类的病因。”

在进行以外线粒体测序后，研究工作执法人员从青年人的肝脏样本中都分离成28种不同子类的致病之外细胞会，并测了这些细胞会中都的基因组表述。“我们在图集中都看到，每种病原体子类都有不同的eQTL结果，这可以告诉我们细胞会子类之间基因组调节的关联性，以及哪种细胞会子类对于的发展哪种病因至关最重要。”研究工作执法人员说道。

作者年度报告说道，“在基因组表述分析中都，我们在一个网络服务上对多个IMD顺利进行比较，使我们只能描述每个病因（病变）的特征，并识别与单个病因特异性之外的基因组，以及在一组IMD中都失调的通路……我们的样本集使我们只能检测每个特定细胞会子类中都eQTL波动的生理（病因）背景驱动的干扰。”

研究工作执法人员将得到的能源命名为大阪大学病原体基因组表述图集（ImmuNexUT），并说道它代表了使用东亚国家后裔青年人构建的第二大的eQTL样本集。他们总结道：“我们确定了病原体子类特异性的eQTL波动，还包括以前未媒体报道的罕见细胞会子类，它们在生理炎症条件下的多样性，以及这些eQTL与IMD遗传之间的值得注意关联。”

“到目前为止，在这一教育领域，大规模的线粒体和特性线粒体研究工作主要是利用中都欧ACS顺利进行的，尽管群体多样性对于正确理解线粒体特性至关最重要。”研究工作执法人员说道，“这个欧美受试者的eQTL图集对于克服这种以中都欧为中都心的偏见，结合中都欧的样本集进一步研究工作DNA变异的特性，也具有最重要含义。”

研究工作执法人员想ImmuNexUT在线将暂时增长，并最终为病变促使非常好的结果。他们说道：“与之前媒体报道的能源相比，我们的样本集具有独有而有利的特点，还包括进一步的病原体细分、ACS之间致病精神状态的转变以及都是的非中都欧ACS。”